Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930480E11RikQ0VG34 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930480E11RikQ0VG34 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms