Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim24Q0VG18 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms