Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms