Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc1Q0VDN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms