Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83bQ0VBM2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam83bQ0VBM2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam83bQ0VBM2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms