Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms