Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Neurl1bQ0MW30 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Neurl1bQ0MW30 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms