Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TrioQ0KL02 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms