Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kndc1Q0KK55 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kndc1Q0KK55 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms