Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms