Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cass4Q08EC4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms