Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ssrp1Q08943 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ssrp1Q08943 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms