Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms