Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Calb2Q08331 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms