Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdx4Q07424 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdx4Q07424 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms