Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms