Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah2Q06986 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms