Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah1bQ06985 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms