Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrstQ06666 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms