Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms