Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnal1Q05A62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms