Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms