Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox9Q04887 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox9Q04887 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms