Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx2Q04744 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx2Q04744 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms