Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcad1Q04692 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms