Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RelaQ04207 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RelaQ04207 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms