Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnb1Q03717 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms