Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms