Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp11Q02853 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp11Q02853 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms