Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms