Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NfiaQ02780 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms