Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Htr1fQ02284 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms