Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snai1Q02085 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms