Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VcpQ01853 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VcpQ01853 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VcpQ01853 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms