Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd1Q01822 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms