Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col1a2Q01149 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col1a2Q01149 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms