Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrcdQ00LT2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms