Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Serpina1cQ00896 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms