Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SeleQ00690 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms