Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga4Q00651 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms