Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apoa1Q00623 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apoa1Q00623 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms