Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd80Q00609 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd80Q00609 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms