Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms