Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou2f2Q00196 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou2f2Q00196 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou2f2Q00196 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms