Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33aP97950 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33aP97950 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms