Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cry1P97784 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms