Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr2cP97760 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2cP97760 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms