Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcc1P97496 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcc1P97496 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms