Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx2P97474 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx2P97474 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms