Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Npas2P97460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas2P97460 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms